Structuration génétique mitochondriale chez l'huître plate Ostrea edulis L. le long des côtes européennes, et comparaison avec la différentiation nucléaire

Autre(s) titre(s) Mitochondrial genetic structure in the flat oyster Ostrea edulis L. along european coasts, and comparison with nuclear differentiation
Type Mémoire
Date 1999
Langue(s) Français
Référence Rapport de Stage Mémoire DEA
Auteur(s) Diaz Almela Elena
Mot-Clé(s) Génétique population, Huître plate, Ostrea edulis, Microsatellite, ARNr mitochondrial 12S, Diversité génétique
Résumé La structuration géographique des populations naturelles d'huître plate (Ostrea edulis) a été étudiée à partir de l'analyse du polymorphisme de conformation simple brin (SSCP), d'un fragment d'environ 300 pb du gène de l'ARNr mitochondrial 12S. les échantillons (13 localités, 507 individus) utilisés avaient fait l'objet d'une étude antérieure de structuration des populations avec 5 locus microsatellites. Il ont été analysés ici dans le but d'une comparaison des structurations observées sur marqueurs mitochondrial et nucléaire. La diversité moyenne intrapopulation du gène de l'ARNr 12S (Hn.b = 0,494) est presque la moitié de celle estimée avec les microsatellites (Hn.b = 0,904) bien que la variance entre populations soit beaucoup plus forte pour l'ADN mitochondrial. Il n'exite pas de corrélation significative entre les diversités estimées des deux marqueurs. Le Fst, estimé par le Théta de Wier et Cockerham, est significatif dans l'ensemble de l'échantillonnage (Theta = 0,179) et à l'intérieur de l'Atlantique (Tetha = 0,153) mais pas au sein de la Méditerranée. Il est sept fois plus grand que le Fst estimé avec l'ensemble des locus microsatellites. Les dendrogrames des échantillons obtenus avec les deux corrélations significatives des distances génétiques (mesurées par Theta/(1-Theta)) et géographiques. Nous discutons des causes possibles des différences observées (faible effectif efficace et haploïdie de l'ADN mitochondrial, forts taux de mutation des microsatellites....). De nouveaux échantillons provenant de la Mer Noire montrent une forte différenciation avec les stocks de Méditerranée et d'Atlantique, ainsi que de très faibles diversités haplotypiques. Ces résultats suggèrent un faible flux génique entre ces mers et l'existence d'un goulot d'étranglement récent.
Texte intégral
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Comment citer 

Diaz Almela Elena (1999). Structuration génétique mitochondriale chez l'huître plate Ostrea edulis L. le long des côtes européennes, et comparaison avec la différentiation nucléaire. Rapport de Stage Mémoire DEA. https://archimer.ifremer.fr/doc/00033/14381/