| Type |
Article |
| Date |
2018 |
| Language |
English |
| Other localization |
https://www.iccat.int/Documents/CVSP/CV074_2017/n_6/CV074062887.pdf |
| Author(s) |
Rouyer Tristan1, Brisset Blandine1, Bonhommeau Sylvain 2, Fromentin Jean-Marc1 |
| Affiliation(s) |
1 : IFREMER, - UMR MARBEC 248, Av. Jean Monnet, 34200 Sète, France
2 : IFREMER, - Le Port, La Réunion, France |
| Source |
Collective volume of scientific papers ICCAT (1021-5212) (International Commission for the Conservation of Atlantic Tunas), 2018 , Vol. 74 , N. 6 , P. 2887-2902 |
| Note |
SCRS/2016/200 |
| Keyword(s) |
Bluefin tuna, scientific cloud, stock assessment, grid computing, online processing |
| Abstract |
<p>Se describe un enfoque que hace posible ejecutar online el conjunto de códigos utilizados para la evaluación del stock de atún rojo del este (BFTE) de ICCAT. En 2014, el Grupo de especies de atún rojo de ICCAT ha podido ejecutar miles de ensayos de modelos utilizando la paralelización de códigos R y Fortran en un superordenador. Este nuevo enfoque tiene muchos beneficios científicos, pero muy pocos participantes podrían reproducirlo sin unas capacidades específicas. Desde noviembre de 2015, el H2020 BlueBridge project está financiando un ingeniero para crear un sitio web (o VRE de Entorno de investigación virtual) en el que los usuarios puedan parametrizar y ejecutar varios pasos del trabajo de la evaluación de atún rojo del este. Reempaquetando los códigos facilitados por el grupo de especies de atún rojo de ICCAT, los mismos códigos son ahora ejecutables online. Pueden ser parametrizados, ejecutados y editados por cualquiera a partir de una simple página web y los resultados se presentan en un formato de datos estándar. En esta etapa, este VRE viene con varios servicios web de colaboración: un espacio de trabajo para compartir documentos o datos, páginas web o servidor RStudio para procesar los datos online y un servicio de comunicación automatizado para generar documentos de forma dinámica empaquetando estos resultados. Dicho entorno de colaboración permite almacenar y acceder a todo el conjunto de datos y códigos fuente para replicar resultados pasados o intentar nuevas parametrizaciones del modelo con herramientas usuales o formularios web simples. Se prevé que dicho enfoque proporcione más transparencia y colaboración entre los grupos de trabajo.</p> |
| Full Text |
| File |
Pages |
Size |
Access |
| Publisher's official version |
16 |
1 MB |
Open access |
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