Changements adaptatifs induits par la pêche chez les populations halieutiques

Autre(s) titre(s) Fishing-induced adaptive changes in harvested populations
Type Thèse
Date 2011-09-13
Langue(s) Français
Auteur(s) Marty Lise
Université AGROCAMPUS OUEST, Vie-Agro-Santé
Discipline Halieutique
Directeur de thèse Marie-Joëlle Rochet
Co-directeur Ernande Bruno
Financement Projet européen FinE
Mot-Clé(s) : Pêche, évolution adaptative, plasticité phénotypique, norme de réaction, dérive génétique, érosion génétique, age et taille à maturation, croissance, survie, trade-offs, densité-dépendance, gadidées de mer du nord
Résumé La pêche est une importante source de mortalité chez les populations exploitées et peut donc induire des changements adaptatifs chez celles-ci. Ces réponses portent notamment sur les traits d’histoire de vie, qui affectent eux-mêmes la dynamique des stocks et peuvent donc altérer l’effet démographique direct de la pêche (i.e. la réduction de la biomasse des stocks). Les changements adaptatifs induits par la pêche reposent, de manière non exclusive, sur deux processus : l’évolution et la plasticité phénotypique. Ces deux composantes sont observées au niveau phénotypique, car les gènes fonctionnels codant pour les traits subissant des changements adaptatifs n’ont pas été identifiés à ce jour. Or, ces deux origines possibles sont confondues dans les phénotypes des individus, et l’impact à long terme des changements adaptatifs demeure donc incertain : la réversibilité des changements d’ordre évolutif est supposée lente et/ou complexe, alors que les changements plastiques peuvent en principe s’inverser totalement en une génération. De plus, puisqu’elle diminue la taille des populations, la pêche peut également accélérer la dérive génétique affectant la composition génétique à la fois neutre et fonctionnelle des populations exploitées. Cette thèse porte sur les changements adaptatifs des traits d’histoire de vie induits pas la pêche, l’accent étant mis sur l’âge et la taille à maturation, et s’appuie sur les gadidés de mer du Nord pris comme cas d’étude. Elle comprend quatre parties.
Keyword(s) fishing, adaptive evolution, phenotypic plasticity, reaction norm, genetic drift, genetic erosion, age and size at maturation, growth, survival, trade-offs, density-dependence, North sea Gadoids
Résumé en anglais Fishing is an important source of mortality in harvested populations and therefore may induce adaptive responses. These responses affect life-history traits in particular, which have consequences for stocks’ dynamics, and thus can alter the demographic direct effect of fishing (i.e. the reduction in stock’s biomass). Fishing-induced adaptive changes depend, non-exclusively, on two processes: evolution and phenotypic plasticity. These two components are observed at the phenotypic level because functional genes coding for the traits undergoing adaptive changes have not yet been identified. These two origins are confounded in individual phenotypes, and the impact of adaptive changes in the long run remains therefore unclear: evolutionary changes are expected to be slowly and/or hardly reversible, whereas plastic ones are in principle reversible in one generation. Furthermore, because it decreases total population size, fishing may also accelerate the rate of genetic drift that affects the neutral and functional genetic composition of harvested populations. This thesis is about adaptive changes in life-history traits induced by fishing, with a special focus on age and size at maturation and a case study on North Sea gadoids. It comprises four parts.
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