| Other titles |
Etude en taxonomie numérique de bactéries gram négatif isolées du milieu marin antarctique |
| Type |
Proceedings paper |
| Date |
1982 |
| Language |
English |
| Author(s) |
Tanner A.C.1, Herbert R.A.2 |
| Affiliation(s) |
1 : British Antartic Survey, Madingley Road, Cambridge, U.K
2 : University Dundee, Department of Biological Sciences, U.K |
| Meeting |
Deuxième colloque de microbiologie marine – Université de Provence, Marseille 24-25 juin 1981 |
| Source |
Publications du Centre National pour l'Exploitation des Océans (CNEXO). Série : Actes de colloques, n° 13, 1982, pp. 31-38 |
| French abstract |
Un total de 144 bactéries isolées d'échantillons d'eau et de sédiments de l'antarctique, et six souches de référence ont été décrites selon 94 caractères biochimiques, morphologiques, nutritionnels et physiologiques. Les résultats ont été analysés par ordinateur en utilisant, pour le calcul de la similitude globale,les coefficients de liaison simple (SSM) et les coefficients de Jaccard (Sj). Les regroupements ont été réalisés par la méthode de la liaison moyenne. A partir du dendrogramme on constate que 140 souches, soit 97 % du total, se sont regroupées en dix phénons formés à plus de 70 % de similitude. Seulement 76 % des bactéries ont pu être identifiées. Ils comprennent des représentants des genres, Vibrio / Aeromonas 50 % ; Alcaligenes 22 % ; Pseudomonas 2 % et Flavobacterium 2 %. Les organismes restant n'ont pu être identifiés à des bactéries déjà décrites dans la 8e Edition du Bergey's Manual ofDeterminative Bacteriology. Si quelques unes des souches ressemblent à une espèce nouvellement décrite, sous le nom de Vibrio fluvialis sp. nov., les autres représentent des espèces non encore décrites. |
| Abstract |
One hundred and forty four Gram-negative bacteria, indigenous to the maritime Antarctic environment, together with six reference strains, were examined for ninety four unit characters, including morphology, production of exoenzymes, growth temperature characteristics and ability to utilize various organic carbon sources. The resulting data were analysed using the Ssm and Sj similarity coefficients with the UPGMA algorithm. At a 70% level of similary, 97% of the isolates were included in ten clusters. 50% of the isolates were identified as belonging to the genera Aeromonas/Vibrio ; 22 %, Alcaligenes ; 2%, Pseudomonas ; and 2% Flavobacterium. The remainder could not easily be identifed with bacteria previously described in the Eighth edition of Bergey's Manual of Determinative Bacteriology. Whilst some of these isolates resembled a proposed new species, Vibrio fluvialis sp. nov., others may weIl represent previously undescribed bacteria. |
| Full Text |
| File |
Pages |
Size |
Access |
| 40952.pdf |
8 |
312 KB |
Open access |
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