FN Archimer Export Format
PT C
TI Workflows novateurs pour une analyse métabolomique plus claire et plus intégrative
OT Innovative workflows towards more transparent and integrative metabolomics analysis
BT 
AF MONDEGUER, Florence
   Allard, Pierre-Marie
   Souard, Florence
   Elie, Nicolas
   Guitton, Yann
   SIBAT, Manoella
   SIANO, Raffaele
AS 1:1;2:2;3:3,4;4:5;5:6;6:1;7:1;
FF 1:PDG-ODE-DYNECO-PHYC;2:;3:;4:;5:;6:PDG-ODE-DYNECO-PHYC;7:PDG-ODE-DYNECO-PELAGOS;
C2 IFREMER, FRANCE
   UNIV GENEVA, SWITZERLAND
   UNIV GRENOBLE ALPES, FRANCE
   UNIV LIBRE BRUXELLES, BELGIQUE
   UNIV PARIS SUD, FRANCE
   ONIRIS, FRANCE
SI NANTES
   BREST
SE PDG-ODE-DYNECO-PHYC
   PDG-ODE-DYNECO-PELAGOS
UR https://archimer.ifremer.fr/doc/00485/59662/62721.pdf
LA French
DT Poster
AB Au cours de leur cycle de vie, Alexandrium minutum et Scrippsiella donghaienis peuvent produire des kystes résistants et revivifiables qui peuvent s'accumuler dans les sédiments marins pendant des centaines d'années. Notre hypothèse de travail suppose que ces deux genres ont "enregistré" leur adaptation à des changements écosystémiques dans ces cellules préservées sous la forme de kystes. À partir de ces kystes revivifiés, des cultures de dinoflagellés toxiques et non toxiques (Alexandrium minutum et Scrippsiella donghaienis) ont été analysées par une approche métabolomique afin d'étudier les réponses adaptatives possibles du phytoplancton à ces modifications des écosystèmes côtiers. Les souches ont été obtenues à partir de sédiments datés isotopiquement, 1986 et 1996 pour "anciens" et 2006 pour "modernes". Au total, 84 échantillons ont été obtenus. Chaque condition expérimentale (combinaisons d'espèces, âge, phase de croissance) a été cultivée en triple. Des extraits de différentes phases de croissance des souches anciennes et modernes d'Alexandrium minutum et de Scrippsiella donghaienis ont été analysés par LC-HRMS et comparés via de 2 workflows: une plateforme de chimiométrie, Agilent Mass Profiler Professional (MPP) et le portail collaboratif "Workflow4Metabolomics". Il est intéressant de noter qu'indépendamment des workflows utilisés (MPP ou Galaxy), les profils métabolomiques de cultures réactivées à des âges différents étaient plus différents que ceux de phases de croissance différentes. Alors qu'A. Minutum ne montrait pas de manière générale les métabolites spécifiques des différentes étapes mais seulement des composés communs, S. donghaienis contenait des métabolites spécifiques pour le déficit en phosphore. L'analyse du réseau moléculaire (GNPS-MetGem) a permis de mieux comprendre ces métabolites produits dans des conditions de carence en phosphore. 
AB During their life cycle, Alexandrium minutum and Scrippsiella donghaienis can produce resistant and revivable cysts that can accumulate in marine sediments for hundreds of years. Our working hypothesis assumes that these two genera have "recorded" their adaptation to ecosystem changes in these cells preserved in the form of cysts. From these revived cysts, toxic and non-toxic dinoflagellate cultures (Alexandrium minutum and Scrippsiella donghaienis) were analyzed by a metabolomic approach to investigate the possible adaptive responses of phytoplankton to these changes in coastal ecosystems. The strains were obtained from isotopically dated sediments, 1986 and 1996 for "old" and 2006 for "modern". In total, 84 samples were obtained. Each experimental condition (species combinations, age, growth phase) was grown in triplicate. Extracts from different growth phases of the ancient and modern strains of Alexandrium minutum and Scrippsiella donghaienis were analyzed by LC-HRMS and compared via two workflows: a chemometrics platform, Agilent Mass Profiler Professional (MPP) and the collaborative portal "Workflow4Metabolomics". It is interesting to note that regardless of the workflows used (MPP or Galaxy), the metabolomic profiles of cultures reactivated at different ages were more different than those of different growth phases. While A. Minutum did not generally show the specific metabolites of the different stages but only common compounds, S. donghaienis contained metabolites specific for phosphorus deficiency. Molecular network analysis (GNPS_MetGem) provided a better understanding of these metabolites produced in case of phosphorus deficiency. 
PY 2019
PD MAR
ID 59662
ER

EF