FN Archimer Export Format
PT C
TI Première évaluation de la diversité des communautés microbiennes planctoniques au cours d'épisodes de mortalité des moules bleues en France : utilisation de l'approche de métabarcoding pour l'analyse de l'ADN environnemental
BT 
AF PEPIN, Jean-Francois
   BOUGET, Jean-Francois
   CHABIRAND, Jean-Michel
   CHASSELIN, Leo
   COSTES, Louis
   GRIZON, James
   LEJOLIVET, Aurore
   LE NOC, Sandrine
   PALVADEAU, Hubert
   SCHMITT, Anne
   SEUGNET, Jean-Luc
   SOLETCHNIK, Patrick
   TRAVERS, Marie-Agnes
   TOURBIEZ, Delphine
   GUESDON, Stephane
AS 1:1;2:2;3:3;4:1;5:1;6:3;7:4;8:4;9:5;10:6;11:1;12:1;13:7;14:7;15:1;
FF 1:PDG-ODE-LITTORAL-LERPC;2:PDG-ODE-LITTORAL-LERMPL;3:PDG-ODE-LITTORAL-LERPC;4:PDG-RBE-SGMM-LGPMM;5:PDG-ODE-LITTORAL-LERBN;6:PDG-ODE-LITTORAL-LERPC;7:PDG-ODE-LITTORAL-LERBN;8:PDG-ODE-LITTORAL-LERBN;9:PDG-RBE-SGMM-PMMB;10:PDG-ODE-LITTORAL-LERMPL;11:PDG-ODE-LITTORAL-LERPC;12:PDG-ODE-LITTORAL-LERPC;13:PDG-RBE-SGMM-LGPMM;14:PDG-RBE-SGMM-LGPMM;15:PDG-ODE-LITTORAL-LERPC;
C1 IFREMER, PDG-ODE-LITTORAL-LERPC, Station de La Tremblade, Avenue de Mus de Loup, F-17390 La Tremblade, France
   IFREMER, PDG-ODE-LITTORAL-LERMPL, Station de Lorient, 8, rue François Toullec, F-56100 Lorient, France
   IFREMER, PDG-ODE-LITTORAL-LERPC, Station de La Rochelle, Place Gaby Coll, BP 7, F-17137 L'Houmeau, France
   IFREMER, PDG-ODE-LITTORAL-LERBN, Station Ifremer de Dinard - CRESCO, 38 rue du Port Blanc, F-35800 Dinard, France
   IFREMER, PDG-RBE-SGMM-PMMB, Station de Bouin, Polder des Champs, F-85230 Bouin, France
   IFREMER, PDG-ODE-LITTORAL-LERMPL, Centre Atlantique, Rue de l'Ile d'Yeu, BP 21105, F-44311 Nantes Cedex 03
   IFREMER, PDG-RBE-SGMM, Station de La Tremblade, Avenue de Mus de Loup, F-17390 La Tremblade, France
C2 IFREMER, FRANCE
   IFREMER, FRANCE
   IFREMER, FRANCE
   IFREMER, FRANCE
   IFREMER, FRANCE
   IFREMER, F-44311 NANTES CEDEX 03
   IFREMER, FRANCE
SI LA ROCHELLE
   LORIENT
   DINARD
   BREST
   LA TREMBLADE
   BOUIN
   NANTES
SE PDG-ODE-LITTORAL-LERPC
   PDG-ODE-LITTORAL-LERMPL
   PDG-ODE-LITTORAL-LERBN
   PDG-IRSI-BIOINFO
   PDG-RBE-SGMM-LSEM
   PDG-RBE-SGMM-LGPMM
   PDG-RBE-SGMM-PMMB
UR https://archimer.ifremer.fr/doc/00505/61664/65579.pdf
LA French
DT Poster
DE ;MORBLEU;Moules;Mortalité;ADN environnemental;eDNA;Metabarcoding;Communautés microbiennes
AB Dans le cadre d’une étude associée aux épisodes de mortalité des moules bleues en France, visant à décrire et comprendre les facteurs qui peuvent favoriser ces mortalités, un panel de paramètres biotiques et abiotiques ont été suivis sur différents sites entre 2015 et 2018. Ce projet a été cofinancé par Ifremer et la DPMA (étude MORBLEU, MORtalité des moules BLEUes). Parmi les facteurs biotiques évalués, une approche basée sur l’ADN environnemental de la colonne d’eau a permis de décrire dans l’espace et dans le temps l’évolution de la dynamique et de la diversité des communautés microbiennes planctoniques, procaryotes et eucaryotes (NGS, metarbarcoding). Nous détaillons la stratégie d’échantillonnage utilisée, les matériels et méthodes mis en œuvre au cours du projet, du prélèvement au séquençage ADNe et quelques résultats préliminaires.     
AB Since 2014 in France, in Charente maritime and Vendée, farmed and stocks of blue mussels experienced strong mortality events. In this context, the « MORBLEU » research project (DPMA-Ifremer agreement) was initiated to explore potentially aggravating factors, associated or correlated with mortality of mussels. Here, the work is to study biotic factors in mussels environment, looking for describe diversity and evolution of microbial communities (water column) before, during and after mortality events using NGS technology (metabarcoding) for environmental DNA analysis. We present, sampling strategy used from 2015 to 2018, Material & Methods and some preliminary results.   
PY 2019
ID 61664
ER

EF