OBEPINE : une expérience française de suivi de l’épidémie de Covid-19 à travers les eaux usées

OBEPINE: a French experiment to monitor the Covid-19 epidemic through wastewater

Type Article
Date 2021
Language French, English
Author(s) Maréchal Vincent1, Moulin Laurent2, Maday Yvon3, Boni Mickael4, Teyssou Rémy4, Wurtzer Sébastien2, Mouchel Jean-Marie5, Bertrand Isabelle6, Gantzer Christophe6, Le Guyader Soizick7
Affiliation(s) 1 : Sorbonne Université, INSERM, Centre de Recherche Saint-Antoine, Paris, France
2 : Eau de Paris, R&D Laboratory, DRDQE Ivry/Seine, France
3 : Sorbonne Université, CNRS, Université de Paris, Laboratoire Jacques-Louis Lions (LJLL), et Institut Universitaire de France, Paris, France
4 : Institut de recherche biomédicale des armées, Brétigny-sur-Orge, France
5 : Sorbonne Université, CNRS, EPHE, UMR 7619 Metis, e-LTER Zone Atelier Seine, Paris, France
6 : Université de Lorraine, CNRS, LCPME, F-54000, Nancy, France
7 : Ifremer, laboratoire de Microbiologie, SG2M/LSEM, BP 21105, 44311 Nantes, France
Source Bulletin de l'Académie vétérinaire de France (00014192) (PERSEE Program), 2021 , Vol. 174 , P. 12p.
DOI 10.3406/bavf.2021.70970
French abstract

Le consortium de recherche Obépine (Observatoire Épidémiologique dans les Eaux Usées) s’est attaché, depuis mars 2020, à exploiter la présence du SARS-CoV-2 dans les eaux usées pour proposer un suivi épidémiologique de la COVID-19 en France. Bien que l’épidémiologie des eaux usées soit une discipline déjà ancienne, elle n’a jamais connu de déploiement aussi important à l’échelle nationale et internationale. Réunissant des équipes de recherche aux compétences variées, Obépine a établi les premiers protocoles de quantification du génome viral dans eaux usées des stations de traitement des eaux usées (STEU). Le réseau sentinelle qui a été construit avec l’appui du Ministère français de l’Enseignement supérieur, de la Recherche et de l’Innovation comprend à ce jour 200 STEU en France métropolitaine et outre-mer. Il permet d’évaluer de façon bihebdomadaire la dynamique de l’épidémie dans plus de 33 % de la population française. Cet article présente la genèse d’un projet de surveillance et les axes de recherche d’un réseau qui souhaite s’attacher - dans un futur proche – à compléter les dispositifs d’alerte précoce et de suivi des infections endémiques ou émergentes existants.

Keyword(s) SARS-CoV-2, COVID-19, wastewater epidemiology, sentinel network
Abstract

Since March 2020, the Obépine (Observatoire Epidémiologique dans les Eaux Usées) research consortium has been working on exploiting the presence of SARS-CoV-2 in wastewater to propose epidemiological monitoring of COVID-19 in France. Although wastewater epidemiology is a long-standing discipline, it has never been so widely deployed on a national and international scale. Bringing together research teams with varied skills, Obépine has established the first protocols for quantifying the viral genome in samples from wastewater treatment plants (WWTPs). The sentinel network, which was built with the support of the French Ministry of Higher Education, Research and Innovation, currently includes 200 WWTPs in mainland France and overseas. It allows the bi-weekly assessment of the dynamics of the epidemic in more than 33% of the French population. This paper presents the genesis of a surveillance project and the lines of research of a network that wishes to work - in the near future - to complete the existing early warning and monitoring systems for endemic or emerging infections.

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Maréchal Vincent, Moulin Laurent, Maday Yvon, Boni Mickael, Teyssou Rémy, Wurtzer Sébastien, Mouchel Jean-Marie, Bertrand Isabelle, Gantzer Christophe, Le Guyader Soizick (2021). OBEPINE : une expérience française de suivi de l’épidémie de Covid-19 à travers les eaux usées / OBEPINE: a French experiment to monitor the Covid-19 epidemic through wastewater. Bulletin de l'Académie vétérinaire de France, 174, 12p. Publisher's official version : https://doi.org/10.3406/bavf.2021.70970 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00751/86256/