TNPC software - Traitement Numérique des Pièces Calcifiées / Numerical Treatment of Calcified Structures : Développement d’un logiciel dédié à l’analyse des pièces calcifiées :

Type Poster
Date 2013
Langue(s) Français
Auteur(s) Fave Sébastien1, Crepin Emeline1, Magalhaes José Ramos1, Ogor Andre2, de Pontual HeleneORCID2, Mahe KeligORCID2
Affiliation(s) 1 : VSG3D, France
2 : Ifremer, France
Conférence Colloque de Sclérochronologie : Structures dures ou calcifiées chez les organismes aquatiques : leur utilisation en écologie halieutique, 2-4 Juillet 2013, Rennes
Résumé Chaque année, près d’1 million de pièces calcifiées (dont 35 000 en France) sont analysées pour l’évaluation de l’état des ressources marines. De plus, beaucoup de thématiques de recherche nécessitent elles-aussi l’utilisation de ces pièces calcifiées. Ainsi, depuis plus de 20 ans, un partenariat entre la société VSG (Visualization Sciences Group anciennement Noesis) et l’institut de recherche IFREMER (Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer) a permis de développer le logiciel d'analyse d'images dédié aux pièces calcifiées, nommé TNPC (Traitement Numérique des Pièces Calcifiées, www.tnpc.fr). Divers projets de recherche et collaborations en particulier avec l’ENIB (Ecole Nationale des Ingénieurs de Brest) ont été nécessaires pour finaliser ce logiciel. Il a été conçu et développé à l’origine par le laboratoire de Sclérochronologie des Animaux Aquatiques de l’IFREMER de Brest. Ce logiciel permet une assistance à la quantification et à l’interprétation des pièces calcifiées, un stockage numérique de matériel biologique pouvant se dégrader avec le temps, une facilité d’échange des données entraînant une meilleur qualification de l’estimation d’âge et enfin une diminution des coûts avec des processus d’automatisation. Ce logiciel développé au départ pour les poissons est aussi utilisé actuellement pour d’autres animaux comme les céphalopodes ou les mollusques. Il possède de nombreuses fonctions : acquisition d’images individuelles et en série, annotation en direct des images, interprétation et mesures, analyse de forme, base de données, estimation automatique de l’âge individuel ou de structures d’âge… En 2013, la version 7 du logiciel intégrée à la plate-forme Visilog 7 est disponible.
Texte intégral
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Comment citer 

Fave Sébastien, Crepin Emeline, Magalhaes José Ramos, Ogor Andre, de Pontual Helene, Mahe Kelig (2013). TNPC software - Traitement Numérique des Pièces Calcifiées / Numerical Treatment of Calcified Structures : Développement d’un logiciel dédié à l’analyse des pièces calcifiées :. Colloque de Sclérochronologie : Structures dures ou calcifiées chez les organismes aquatiques : leur utilisation en écologie halieutique, 2-4 Juillet 2013, Rennes. https://archimer.ifremer.fr/doc/00148/25905/