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Joubert Etienne, Seve Charlotte, Mahevas Stephanie, Bach Adrian, Bouchoucha Marc

Conservation measures are implemented to support biodiversity in areas that are degraded or under anthropogenic pressure. Over the past decade, numerous projects aimed at rehabilitating a fish nursery function in ports, through the installation of artificial structures, have emerged. While studies conducted on these solutions seem promising on a very local scale (e.g., higher densities of juvenile fish on artificial fish nurseries compared to bar [...]

Sub-Antarctic glacier chronologies can provide valuable information about the past variability of climate dynamics in the Southern Ocean region. The Kerguelen Archipelago (49°S) is advantageously located under the influence of the Southern Hemisphere's westerly wind belt, thus fluctuations of climate-sensitive glaciers on Kerguelen can provide a baseline for understanding the behavior of this atmospheric regime in response to climatic forcings. W [...]

Despite intensified efforts to better quantify Internal Tide dynamics over past decades, large uncertainties remain regarding their distribution and lifecycle in the ocean. In particular, internal tide incoherence (loss of time‐regularity) has limited our ability to characterize, understand, and predict internal tides, challenging the exploitation of new‐generation wide‐swath satellite altimeters. Based on a realistic high‐resolution numerical si [...]

Satellite altimeters are the most common source of wave measurement in phenomenal sea states, with significant wave heights exceeding 14 m. Unfortunately their data is still considered with skepticism, because there is usually no other data to verify the accuracy of the largest values. Here we investigate the self‐consistency of the measurement, and their small scale variability, in order to define an estimate of satellite altimeter precision. Us [...]

Fablet Ronan, Chapron Bertrand, Le Sommer J., Sévellec Florian

Satellite altimetry offers a unique approach for direct sea surface current observation, but it is limited to measuring the surface‐constrained geostrophic component. Ageostrophic dynamics, prevalent at horizontal scales below 100 km and time scales below 10 days, are often underestimated by ocean reanalyzes employing data assimilation schemes. To address this limitation, we introduce a novel deep learning scheme, rooted in a variational data ass [...]

Raux Pascal, Cisneros Lorena, Levain Alix, Menez Florence, Leonardi Sophie

Le printemps a commencé, et avec lui les travaux de terrain : enquêtes, entretiens… Où trouver un guide clef en main pour mettre en œuvre la démarche RGPD ? Peut-on emprunter un enregistreur au sein du labo ? Comment utiliser le logiciel de transcription NOOTA disponible au sein du labo ? Autant de questions qui fleurissent avec le rallongement de la durée d’ensoleillement ! Toujours dans l’idée de vous accompagner au mieux et de partager les r [...]

Pepin Jean-Francois, Curd Amelia, Massé Cécile, Bouquet Anne Lise, Daffe Ceriseexpand

Deux espèces non-indigènes (ENI) marines récemment observées dans le golfe de Gascogne menacent potentiellement la conchyliculture et la biodiversité des côtes atlantiques et méditerranéennes de la France. La première ENI est le Muricidae Rapana venosa (Valenciennes, 1846) un gastéropode prédateur des bivalves signalé dans la zone du Pertuis Breton du Golfe de Gascogne depuis 2019. La deuxième ENI est un ver Plathelminthe de l’ordre des Polycladi [...]

Cette procédure a pour objet de décrire les différentes tâches du REPHY en Occitanie.

Le Bris Chantal

Ce document consiste à recenser, justifier et exprimer sous forme d’unités d’œuvre les coûts des « moyens informatiques et télécommunications » et ceux des services de bases de données marines de l’IFREMER dans le but d’intégrer le document de tarification 2024. La méthode appliquée pour répartir tous les coûts supportés par ces deux infrastructures fait régulièrement l’objet d’ajustements visant non seulement à une meilleure identification des u [...]

Andrialovanirina Nicolas, Poisson-Caillault Emilie, Mahe Kelig

Dans le cadre d’une pêche durable, subissant un changement global, la connaissance préalable des limites géographiques de chaque population étudiée est requise. Dans cette étude, l’analyse automatique innovante de la forme tridimensionnelle (3D) des otolithes des rougets barbets de la Mer Méditerranée a été comparée à l’analyse conventionnelle en bidimensionnel (2D). Il a été conclu que cette nouvelle technique tridimensionnelle de la forme était [...]

Andrialovanirina Nicolas, Laffont Rémi, Couette Sébastien, Matéos Aurélie, Mahe Keligexpand

The shape of a fish's otolith varies according to its environment, genetics and life stage. To be able to analyse these shapes, standardisation is a crucial step. In this study, a protocol for standardising and aligning 3D reconstructions of the otolith was proposed, based on the extraction of Spherical Fourier Descriptors. This protocol was approved for 20 different fish species.

Giraud-Carrier Charlotte

En Nouvelle-Calédonie, l'élevage de la crevette bleue du Pacifique, Penaeus stylirostris, est une activité socIo­ économique majeure. Cependant, depuis 2005, des mortalités larvaires massives non expliquées dans les écloseries menacent la pérennité des productions. L'eau de mer lagonaire, utilisée pour les élevages;possède des caractéristiques physico-chimiques et des assemblages microbiens susceptibles de varier en fonction de facteurs naturels [...]

La sismothèque Ifremer de Geo-Ocean contient plus de 12000 rouleaux sismiques acquis pendant les campagnes océanographiques entre 1966 et 2002. Ce rapport s’intéresse au moyens de sauvegarder ces rouleaux sismiques anciens et améliorer leur valeur, dans le but de les rendre facilement trouvables, accessibles, interopérables et réutilisables (principes FAIR).

L’étude la biomasse phytoplanctonique est fondamentale pour comprendre le fonctionnement de l’environnement marin car elle est à la base de la chaîne alimentaire. Les études globales menées sur le réchauffement climatique semblent montrer notamment dans l’Atlantique Nord une baisse de cette biomasse associée au réchauffement des eaux marines. En utilisant un proxy de la biomasse phytoplanctonique, la concentration en chlorophylle a, on parvient à [...]

L’objectif de cette thèse est de mieux comprendre et prédire la biodiversité benthique et le rôle des habitats biogéniques, dans le maintien de la structure et des fonctions des écosystèmes côtiers. Cette thèse a exploré différents outils numériques et des pipelines innovants et complémentaires pour répondre à ces objectifs à différentes échelles : 1) la modélisation jointe de la distribution des espèces dans deux habitats biogéniques à une échel [...]

Mattio Elodie

La quantification des métaux dans les milieux aquatiques est un enjeu majeur, au vu de leur toxicité élevée et de leurs nombreuses sources d’émission dans l’environnement. Dans cette optique, le développement de systèmes d’analyse en ligne portables et à bas coût va permettre de réaliser des contrôles répétés et automatisés sur site. Trois métaux ont été ciblés dans cette étude : le plomb, le cadmium et le mercure. Pour développer ces systèmes, l [...]

Eichenberger Franca

How the underlying forces of sexual selection impact reproductive tactics including elaborate acoustic displays in cetaceans remains poorly understood. Here, I combined 26 years (1995-2020) of photo-identification, behavioural, (epi)genetic, and endocrine data from an endangered population of humpback whales (New Caledonia), to explore male reproductive success, age, physiology, and population dynamics over almost a third of the lifespan of a hum [...]

Dimoune Djoirka Minto

The western tropical Atlantic is one of the most dynamic regions of the whole ocean where most of the zonal currents flows transporting water masses with salt and heat. Its importance is mostly due to its interactions with atmosphere which influence the regional climate and the precipitations of the region. During this thesis, the main goal was to take advantage of the larger dataset of the altimetry-geostrophic currents and the GLORYS12V1 (G12V1 [...]

Larranaga Marco

À l'échelle des bassins océaniques, il est reconnu depuis plusieurs décennies que les interactions entre l'océan et l'atmosphère ont une grande influence sur le climat de la Terre. Cependant, les biais persistants des modèles globaux, par exemple en température de surface de la mer, ont mis en exergue les limites d'une approche globale à relativement basse résolution spatiale. Il en a ainsi découlé une nouvelle ligne de recherche basée sur une ap [...]

Kande Yoba

Cette thèse s'inscrit dans le cadre de la statistique fonctionnelle appliquée à l'environnement.La statistique fonctionnelle constitue un domaine de la statistique qui se penche sur des données présentées sous forme fonctionnelle. Elle propose des techniques pour la réduction de dimension, l'apprentissage supervisé et non supervisé, tout en tenant compte des dépendances temporelles et/ou spatiales des données fonctionnelles. Ce type de données es [...]