Dans l'ensemble de la problématique scientifique sur les "eaux marines", le Ministère de l'aménagement du territoire et de l'environnement a fait le choix de mettre la priorité sur l'étude du littoral qui constitue la zone d'interface la plus fragile où les enjeux de durabilité sont les plus importants. Le programme de recherche sur la gestion durable du littoral a été lancé en 1999 par le ministère pour une durée de 5 ans. Il a donné lieu à un financement incitatif d'environ 3 millions d'Euros (soit un investissement total de l'ordre de 10 millions) dont 1 million d'Euros consacrés à approfondir les conséquences d'une pollution accidentelle sur le littoral (suites de l'Erika). Il s'insère dans le dispositif national de recherche sur le milieu marin, en complétant en particulier le programme national d'environnement côtier (PNEC) qui rassemble l'INSU, l'IFREMER et l'IRD.