What role for genomics in fisheries management and aquaculture?

Other titles Quel rôle pour la génomique dans la gestion des pêches et de l'aquaculture ?
Type Article
Date 2007-09
Language English
Author(s) Wenne Roman1, Boudry PierreORCID2, Hemmer-Hansen Jakob3, Lubieniecki Krzysztof P.4, Was Anna5, Kause Antti6
Affiliation(s) 1 : Polish Acad Sci, Inst Oceanol, Dept Gen & Marine Biotechnol, PL-81712 Sopot, Poland.
2 : IFREMER, Lab Genet Pathol, F-17390 La Tremblade, France.
3 : Simon Fraser Univ, Dept Mol Biol & Biochem, Burnaby, BC V5A 1S6, Canada.
4 : Danish Inst Fisheries Res, Dept Inland Fisheries, Silkeborg 8600, Denmark.
5 : Galway Mayo Inst Technol, Mol Ecol Res Grp, Galway, Ireland.
6 : MTT Agrifood Res Finland, Jokioinen 31600, Finland.
Source Aquatic Living Resources (0990-7440) (EDP Sciences), 2007-09 , Vol. 20 , N. 3 , P. 241-255
DOI 10.1051/alr:2007037
WOS© Times Cited 37
French abstract Le développement et l'application de la génomique ont été facilités dans un certain nombre de domaines par la disponibilité de nouveaux outils et de nouvelles méthodes, tels que le séquençage d'ADN à haut débit et les puces à ADN ("microarrays"). Les outils de la génomique sont déjà développés sur les espèces de poissons et d'invertébrés d'importance commerciale. Des milliers d'étiquettes, marqueurs de séquence exprimée (EST) sont désormais disponibles pour quelques unes de ces espèces et le séquençage du génome complet de tilapia, de la morue, de salmonidés, de poissons plats, du bar, et de l'huître creuse sont demandés. La technologie des puces à ADN, au travers d'analyse simultanée de l'expression de milliers de gènes, permet l'identification de gènes candidats impliqués dans les multiples fonctions physiologiques, morphologiques et comportementales chez les organismes et les populations d'environnements variés. Cet article présente la synthèse de récents développements de ces technologies du génome, et met en évidence leurs applications potentielles ainsi que les implications dans la gestion des pêches et de l'aquaculture.
Keyword(s) Oyster, Fish, Quantitative trait loci, Mariculture, Fisheries, Genetics, Genomics
Abstract The development and application of genomics has been facilitated in a number of fields by the availability of new methodologies and tools, such as high throughput DNA sequencing and complementary DNA (cDNA) microarrays. Genomic tools are already used in research on commercially important fish and shellfish species. Thousands of expressed sequence tags (EST) are now available for some of these species, and the sequencing of complete genomes of tilapia, cod, salmonids, flatfishes, sea bass and Pacific oyster has been proposed. Microarray technology through simultaneous analysis of the expression of thousands of genes allows the identification of candidate genes involved in the function of multiple physiological, morphological and behavioural traits of interests in organisms and populations from different environments. This paper reviews the current development of genomic technologies, and pinpoints their potential beneficial applications as well as implications for fisheries management and aquaculture.
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