Créé en 91, le laboratoire Écotoxicologie concrétise la volonté de l'IFREMER de s'investir dans l'une des priorités actuelles, l'environnement. A vocation nationale et internationale, le laboratoire s'est fixé deux objectifs principaux: participer à la mise en place de réseaux de surveillance de la qualité du milieu marin et comprendre les mécanismes d'altération du métabolisme des organismes marins.