L’Ifremer opère de façon coordonnée à l’échelle de l’ensemble du littoral métropolitain plusieurs réseaux de surveillance : le réseau de contrôle microbiologique (REMI), le réseau de surveillance du phytoplancton et des phycotoxines (REPHY), le réseau d’observation de la contamination chimique (ROCCH, ex-RNO) et le réseau de surveillance benthique (REBENT). Ils sont mis en oeuvre pour répondre aux objectifs environnementaux de la Directive Cadre sur l’Eau (DCE), aux obligations des Conventions régionales marines (OSPAR et Barcelone) et aux objectifs sanitaires réglementaires concernant le suivi de la salubrité des coquillages des zones de pêche et de production conchylicoles. La surveillance de la survie et de la croissance des mollusques est assurée par le Réseau Mollusques des Ressources Aquacoles (REMORA) qui est mis en place sur les 3 façades maritimes. Les réseaux de surveillance sont mis en oeuvre par les Laboratoires Environnement Ressources (LER) de l’Ifremer. Ils mettent également en oeuvre des réseaux de surveillance régionaux sur la côte d’Opale (SRN), le littoral normand (RHLN), le bassin d’Arcachon (ARCHYD) et les lagunes méditerranéennes (RSL-RLC), pour approfondir le diagnostic local. Ainsi, le dispositif de surveillance s’enrichit sur certains secteurs littoraux de résultats sur l’hydrologie soutenant l’évaluation de la qualité du milieu.