La Directive Cadre sur l’Eau 2000/60/CE établit un nouveau cadre pour une politique communautaire dans le domaine de l’eau. Elle fixe comme objectif général d’atteindre, à l’horizon 2015, un bon état écologique et chimique des masses d’eau souterraines et de surface, ces dernières incluant les eaux côtières (MEC) et les eaux de transition (MET). Pour évaluer l’état écologique d’une Masse d'Eau (ME), la DCE utilise la notion d’écart par rapport à une situation de référence. Les valeurs de référence, que l’on peut considérer comme niveau étalon du "très bon état écologique", ont été établies par type de ME et par élément de qualité biologique (phytoplancton, macrophytes (macroalgues et phanérogames marines)), faune macro-invertébrée et poissons (exclusivement dans les MET).