Ce document est le deuxième rapport de la synthèse des présentations faites au cours des journées REPHY 1998. Celles ci se sont déroulées à Nantes du 18 au 20 mars et ont réuni plus de 50 participants. Les sujets abordés dans ce deuxième rapport sont rattachés aux thèmes suivants : modélisation, taxonomie, traitement de données REPHY, kystes d'Alexandrium, toxines DSP (méthodes, cinétique de production), toxines PSP (méthodes, détoxification), surveillance ASP, QUADRIGE, assurance qualité.