L'estimation de stocks de mollusques non cultivés et plus particulièrement des moules de gisements naturels a été effectuée pour la première fois dans la Baie de Bourgneuf en Novembre 1986. Cette étude a fourni les résultats suivants; le stock total s'élève à 40 068 tonnes de moules de gisement naturel avec une précision de 49%. Pour obtenir cette estimation globale, trois secteurs ont été échantillonnés : la zone du Fain en eau profonde, qui représente 19 930 tonnes de moules (précision de 58%) et deux secteurs situés dans la zone de balancement des marées, à l'ouest du premier secteur qui sont estimés respectivement à 6 172 tonnes (précision 54%) et 3 966 tonnes (précision 186%). Cette étude montre l'importance des gisements naturels de moules dans ce bassin par rapport aux élevages d'huîtres. Elle fait partie d'un programme de recherche, dont l'objectif est de définir l'importance des stocks conchylicoles dans la baie de Bourgneuf, ceci dans un but de gestion de la ressource.