Cette étude a pour objectif d’améliorer la compréhension des causes des mortalités de naissain d’huîtres creuses Crassostrea gigas en pertuis charentais en lien avec les paramètres environnementaux et la cinétique de détection d’agents infectieux ciblés, tels que les bactéries Vibrio splendidus (groupe) et V. aestuarianus ainsi que l’herpès virus OsHV-1. Deux campagnes d’échantillonnage ont été réalisées sur le site de d’Agnas en 2009 et 2010, avant, pendant ou après les épisodes de surmortalité de naissain, entre mars et septembre. L’approche retenue consiste à détecter et quantifier à pas de temps serrés les agents infectieux dans les tissus d’huîtres creuses d’élevage mises sur table ainsi que dans divers prélèvements réalisés à proximité : huîtres autochtones et autres espèces (moules sauvages et balanes), prélèvements d’eau de mer et de sédiment. Grâce aux sondes physico-chimiques placées sur le site des suivis cinétiques de paramètres environnementaux ont pu être réalisés (température, salinité, turbidité, fluorescence éq. Chlorophylle, Oxygène). Les données de ces paramètres ont permis de noter que les périodes de mortalité sont précédées par une élévation de la température de la colonne d’eau (+0,5°C/jour, >4jours). Des mortalités d’huîtres sont observées six jours environ après ce pic de température, avec une eau à plus de 16°C. La cinétique des bactéries appartenant au groupe Vibrio splendidus montre qu’elles sont très fréquemment détectées chez le naissain échantillonné vivant, avant ou durant les périodes de mortalité. Les niveaux de charges bactériennes détectés dans les tissus n’augmentent pas ou peu durant les périodes de surmortalité. La cinétique de détection de l’ADN viral d’OsHV-1 montre que le virus est faiblement ou pas détecté en dehors des périodes de mortalité alors que sa prévalence augmente rapidement juste avant et durant l’épisode de mortalité. Les niveaux des charges virales détectées dans les tissus s’élèvent très fortement durant les périodes de surmortalité. Le caractère infectieux des mortalités observées est bien établi, cependant la bactérie V. aestuarianus n’a pas été détectée. Cette étude a permis pour la première fois de mettre en évidence de l’ADN viral d’OsHV-1 chez la moule et les balanes mais aussi dans l’eau de mer en dehors ou au cours des épisodes de mortalité. La température paraît jouer un rôle clé dans le déclenchement des mortalités de naissain associées à OsHV-1 et constitue un facteur de risque important.

This study aims to improve understanding of causes of mortalities in oyster Crassostrea gigas in pertuis charentais related to environmental parameters and the kinetics of targeted infectious agents, such as bacteria Vibrio splendidus (group ) and V. aestuarianus and Ostreid herpesvirus OsHV-1. Two sampling campaigns were carried out on the site of Agnas in 2009 and 2010, before, during or following mortality events of spat from March to September. The approach is to detect and quantify in short time step infectious agents from tissues of farmed oysters placed on rack and in various samples taken nearby: native oysters and other species (wild mussels and barnacles), seawater and sediment. With physical and chemical automatic probes placed on the site, environmental parameters kinetics have been achieved (temperature, salinity, turbidity, fluorescence eq. Chlorophyll, Oxygen). Data from these parameters have allowed to note that the periods of mortality are preceded by a rise in temperature of the water column (+0.5°C/day, > 4 days). Oyster mortalities were observed six days after the temperature peak, with water above 16°C. Kinetic of bacteria belonging to the Vibrio splendidus group shows that they are frequently detected in the living spat sampled before or during periods of mortality. The levels of bacterial loads detected in the tissues do not increase or slightly during periods of increased mortality. The kinetic of OsHV-1 viral DNA detection shows that the virus is poorly or not detected except mortality event, while its prevalence is increasing rapidly just before and during mortality outbreaks. The levels of viral loads detected in tissues rise sharply during mortality events. The infectious nature of observed mortalities is well established, however, the bacterium V. aestuarianus was not detected. This study for the first time has allowed to demonstrate OsHV-1 viral DNA in mussels and barnacles, but also in seawater out or during mortality events. The temperature factor appears to play a key role in the onset of mortalities of spat associated with OsHV-1 and is an important risk factor.