Le syndicat des mytiliculteurs de la baie du Mont Saint Michel a demandé à l'IFREMER d'entreprendre une étude de salubrité de la partie Est de la baie du Mont Saint Michel dont le secteur breton, à l'ouest, est classé insalubre depuis 1965. L'étude menée en 1987 et 1988 a porté sur la qualité bactériologique des rejets d'eau douce par les fleuves, la recherche des germes coliformes et streptocoques fécaux, salmonelles et Vibrio parahaemoliticus. L'étude montre l'insalubrité indiscutable de la partie bretonne de l'Est de la baie et que le classement pourrait être étendu à l'ensemble de l'Est de la baie jusqu'à la côte du Cotentin. La conclusion essentielle est que le développement de la conchyliculture dans l'est de la baie du Mont St-Michel apparait inopportun à l'heure actuelle, seules des mesures d'assainissement draconniennes pour éviter les rejets d'origine domestique pourraient permettre une amélioration de la qualité des eaux.