Sous-échantillonner les prélèvements de plancton est souvent une nécessité même si la précision de l'estimation s'en trouve diminuée. Une optimisation méthodologique est recherchée. La variance est fonction de la procédure de construction des sous-échantillons (plan) et du nombre d'individus comptés par sous-échantillon. L'effort attribué au sous-échantillonnage est déterminé à la suite d'une stratégie de répartition de l'effort total entre échantillonnage et sous-échantillonnage. L'effort de sous-échantillonnage est défini par le temps nécessaire pour la procédure de fractionnement, le volume examiné et le nombre d'organismes comptés. Pour un effort donné, une procédure systématique est plus précise qu'une procédure aléatoire puisqu'elle parcourt mieux l'échantillon et elle est ainsi moins influencée par la répartition spatiale des organismes à l'intérieur de la cuve de fractionnement. Il est suggéré de calculer la variance du sous-échantillonnage en routine car les modèles théoriques ne sont pas toujours applicables, surtout pour les organismes abondants.

It is often necessary to sub-sample plankton samples even if the precision of the estimation is thereby decreased. A methodological optimization is looked for. The variance depends on the procedure of construction of the aliquot (strategy) and the number of individuals counted (effort). The sub-sampling effort is allocated in a general context of repartition of the total effort between sampling and sub-sampling. This effort depends on the time consumed by the sub-sampling procedure, the volume of the aliquot and the number of individuals counted. For the same effort, a systematic procedure for the construction of sub-samples is more precise than a random one because it travels through the entire sample and is thus less dependent on the spatial distribution of the organisms in the sub-sampling tank. The calculation of the subsampling variance in routine is suggested because deviations from the theoretical models are frequent, especially for the high levels of abundance.