Par son rôle essentiel dans le fonctionnement des écosystèmes aquatiques, le phytoplancton apparaît comme un indicateur pertinent de la qualité des milieux marins. En métropole, différents groupes de masses d’eau ont été définis, et les grilles qui s’appliquent aux différents indices (biomasse/ chlorophylle a, abondance / proportion de blooms) et qui permettent de classer chaque masse d’eau, sont propres à chaque groupe de masses d’eau. Les trois départements français d’outre-mer étudiés ici (Martinique, Guadeloupe, et La Réunion) se caractérisent par de fortes spécificités environnementales. De manière générale, si les connaissances existantes témoignent du caractère oligotrophe des eaux tropicales, les études localisées permettant de décrire les spécificités des eaux côtières de Martinique, Guadeloupe et Réunion sont rares voire inexistantes. Dans ce contexte, les études et suivis initiés dans le cadre de la DCE revêtent un caractère particulièrement important pour l’acquisition de connaissances sur le phytoplancton dans ces régions. Plusieurs rapports présentent une synthèse des travaux réalisés dans les départements français d'Outre-Mer ( eg., Caffier et Artigas, 2010b ; Buchet, 2008) dans le contexte de la mise en œuvre de la DCE. Une grande partie des données acquises dans le cadre de la DCE pour le phytoplancton et les mesures physico-chimiques associées, en Martinique et Guadeloupe, ont été bancarisées dans la base de données Quadrige² entre fin 2011 et début 2012. Avec les données déjà saisies pour la Réunion, les données bancarisées couvrent actuellement une période variable : globalement à partir de 2007, mais les données des deux années 2010 et 2011 ne sont pas toutes saisies. Pour chaque région, la distribution de la concentration en chlorophylle a varie peu entre les différentes MEC. L'évolution temporelle de la concentration en chlorophylle a apparaît, elle aussi, relativement uniforme. Cette première analyse descriptive des données de chlorophylle a disponibles confirme donc le caractère oligotrophe des eaux côtières antillaises et réunionnaises. L'analyse de l'ensemble des données récemment bancarisées dans la base Quadrige² a permis de réaliser des simulations d’évaluation de la qualité des eaux, avec l’outil développé au niveau national par Ifremer, et d'affiner la proposition de grilles pour l'indice biomasse, adaptées aux eaux ultra-marines (cf. livrable 21). Il convient néanmoins de souligner que les données acquises avec des méthodes non adaptées au mileu marin sont très sujettes à caution : il est donc nécessaire de bancariser le plus rapidement possible les données acquises depuis, avec des méthodes correctes, pour refaire les simulations. La priorité est donc de : (i) bancariser les données récentes, ce qui permettrait de relancer des simulations à l’automne 2012, (ii) planifier le groupe d’experts Phytoplancton et Hydrologie / DOMs, avant fin 2012.