Les journées conchylicoles sont organisées tous les 2 ans par le Département RA afin d'effectuer un point sur l'avancement des travaux de recherche. Elles se veulent être un lieu de discussion et d'échanges entre les différents laboratoires et doivent permettre des présentations orales, y compris par les techniciens de ces laboratoires. C'est une des seules occasions de lieu d'information directe, et de regroupement de l'ensemble des acteurs de ces programmes pendant 2 journées. Lors des journées organisées en 1999, la participation des structures régionales et départementales de transfert avait déjà permis un transfert d'information des résultats IFREMER vers celles-ci. En plus de leur participation, une présentation orale de leurs activités respectives a été effectuée en 2001 afin d'élargir le débat. En 2001, un appel à propositions a été effectué sur l'ensemble des laboratoires RA et unités mixtes. Toutes les propositions ont par la suite été retenues: 43 présentations, réparties en 9 sessions, ont été ainsi effectuées sur les 2 journées, ce qui représente un maximum compte tenu du temps imparti.