La production mondiale de poissons d’élevage augmente rapidement alors que les principaux ingrédients des aliments pour poissons (huiles et farines de poisson issues de la pêche) sont en quantité désormais insuffisante pour répondre à la demande. Cette situation, en Europe notamment, a conduit au remplacement progressif des produits marins par des matières premières végétales. Mais les taux de substitution élevés provoquent des réductions importantes des performances (croissance, voire survie) chez les espèces d’élevage de haut niveau trophique, à forts besoins en protéines et lipides. L’étude du potentiel d’adaptation de plusieurs de ces espèces à des aliments fortement ou totalement substitués (sans huiles ni farines de poisson) a révélé qu’il est possible de sélectionner au sein des populations d’élevage des individus à forte capacité de croissance avec des régimes à base de végétaux. Les mécanismes à l’origine de cette adaptation restent à identifier. Les analyses montrent aussi que les groupes les plus performants varient en fonction de l’aliment (marin ou substitué). Ces interactions génotype-aliment peuvent compliquer la gestion d’un programme de sélection si les reproducteurs sont sélectionnés avec un aliment différent de celui utilisé pour élever leurs descendants. Des simulations du progrès génétique attendu dans différents scénarios alimentaires permettent d’identifier quelques pistes pour optimiser la sélection chez la truite arcen-ciel et le bar, espèces majeures de la pisciculture d’eau douce et marine en France. La combinaison judicieuse de programmes d’amélioration génétique et de parcours alimentaires raisonnés pourrait aider la filière piscicole à évoluer vers un mode de production moins dépendant des ressources naturelles marines, tout en continuant à fournir des produits de qualité au consommateur

World fish farm production is growing rapidly. However, the supply of fishmeal and fish oil, the major ingredients of fish diets, has reached a limit because of the limits in the exploitation of wild fish stocks that cannot be increased to meet a growing demand. The main response, especially in Europe, has been the progressive replacement of fishmeal and fish oil by plant products. However, the strong reduction of growth and sometimes survival of fish fed highly substituted diets has urged research on the genetic potential for adaptation to plant-based diets. Recent results clearly demonstrate that fish can be selected for their capacity to grow when fed plant-based diets, even though the underlying mechanisms remain unknown. Genotype-diet interactions have been shown, indicating that the best performers differ according to the diet. Such interactions may make the management of breeding programmes difficult, as progeny may be reared with a diet differing from the one used to select the breeders. Simulations of the expected genetic gain according to different scenarios can help manage selection programmes for sea bass and rainbow trout, the main farmed species in France. Using both selective breeding and optimized diets provide the opportunity to increase sustainability of fish farming, whilst maintaining product quality.