Du fait de ses caractéristiques météorologiques, hydrologiques et topographiques particulières, la Corse compte un très grand nombre de micro-estuaires temporaires. L’Agriate en renferme plusieurs, dont le micro-estuaire temporaire de Fiume Santu. Ces écosystèmes sont spécifiques de par leur connexion intermittente avec la mer. Ouvertures et fermetures sont surtout rythmées par le débit du cours d’eau et par la formation de banquettes d’herbiers à Posidonia oceanica (L.) Delile. La caractérisation du fonctionnement global du système a été étudiée grâce à une approche multi-paramètres (descripteurs de la matière particulaire, inorganique dissoute, traçage isotopique naturel du carbone et de l’azote, communautés phytoplanctoniques) permettant de quantifier et de qualifier le pool de matière organique le long d’un gradient estuaire – zone côtière. L’origine des sources de matière organique a été caractérisée, révélant ainsi la contribution détritique issue majoritairement de la dégradation des feuilles d’herbiers à P. oceanica. Cette étude a permis de mettre en évidence quatre périodes de fonctionnement distinctes, marquant ainsi un lien étroit entre les facteurs environnementaux, le fonctionnement physique du système et le fonctionnement biologique. Les transferts de matière entre les différents compartiments (sédiment, détritique, colonne d’eau) et milieux (micro-estuaire, réservoirs, baie, proche côtier) de l’écosystème ont été dégagés.

In relation with meteorological, hydrological and topographic characteristics, Corsica has a very large number of temporarily open/closed micro-estuaries. Agriates contains several of them, including the Fiume Santu’s temporarily micro-estuary. These ecosystems are specific because of their sporadic connection with the sea. The opening and closure depends on both the river flow and the presence of the Posidonia oceanica (L.) Delile “banquettes”. Characterization of the global functioning was based on a multiparameter approach (particulate matter and dissolved inorganic matter descriptors, carbon and nitrogen stable isotope, phytoplankton communities), in order to qualify and quantify the organic matter (OM), along an estuary – coastal zone gradient. The OM sources have been characterized, revealing that the detrital OM is resulting from P. oceanica leaves degradation. This study highlighted four critical periods, with the close link between environmental, physical and biological factors. The matter transfers between different compartments (sediment, detrital, water column) and systems (micro-estuary, ponds, bay, coastal area) by the ecosystem were also demonstrated.