L’unité SG2M est structurée pour aborder de manière intégrée les domaines de la santé animale et de la santé humaine liée à production, à la consommation de coquillages, et à la qualité microbiologique du littoral. Ainsi, dans le cadre d’un continuum recherche/surveillance/expertise, et d’une approche pluridisciplinaire, l’unité cherche à développer des connaissances concernant les interactions entre agents infectieux, hôtes et environnement chez les mollusques marins, et les cycles de contamination. Dans le domaine de la recherche, les activités de l’unité sont déclinées selon quatre axes structurants : (1) la microbiologie sanitaire et les voies de transfert des agents pathogènes humains dans l’environnement côtier, (2) l’étude des maladies affectant les mollusques marins, (3) la connaissance des génomes, la domestication et l’amélioration des bivalves, (4) la sécurisation et la purification des coquillages. Un second volet d’activités est développé en lien direct avec ces quatre axes de recherche. Dans le domaine de la surveillance, l’unité SG2M est fortement impliquée dans la surveillance des systèmes de productions conchylicoles et de la qualité sanitaire de la production des coquillages. L’objectif est d'identifier, et de prévenir les risques pouvant avoir un impact sur les productions conchylicoles, en matière de santé publique et de santé animale, au travers de la coordination de deux réseaux (REMI et Repamo) et des missions de Laboratoire de Référence pour l’Union Européenne (LRUE) pour les maladies des mollusques marins, de Laboratoire National de Référence (LNR) pour la microbiologie des coquillages (Nantes) et de LNR pour les maladies des mollusques (La Tremblade). L’Unité via ses activités de recherche, d’expertise et d’avis aux politiques publiques participe à l’évolution des normes, et propose des éléments techniques contributifs à l’optimisation de la gestion des risques dans le contexte des réglementations nationales, européennes et internationales, et ce dans un contexte scientifique européen et international