Descartes 2 propose la mise au point et l'optimisation de protocoles d'échantillonnage qualifiant les biocénoses marines et des ressources halieutiques d'intérêt régional sur deux types de milieux aquitains : la côte basque rocheuse et le bassin d'Arcachon. Tester et définir des méthodes d'échantillonnage fiables, applicables en routine et transférables, requièrent une phase de recherche impliquant des compétences en mathématiques, hydrodynamique, sciences du vivant. Le projet contribuera ainsi, par des actions scientifiques, à l'amélioration des politiques publiques pour la gestion du milieu marin, y compris sur des problématiques transfrontalières. Par ailleurs le projet Descartes 2 vise à contribuer au renforcement durable du partenariat pluridisciplinaire existant avec le monde académique (UPPA) via la Fédération de Recherche MIlieux et Ressources Aquatiques (FR MIRA). Il concerne l'axe de recherche prioritaire « Fonctionnement des populations naturelles et perturbations »pour lequel l'Université affiche des orientations de recherche .