L'evaluation et la gestion des stocks de poissons ont pour objectif d'atteindre une exploitation durable des ressources fournies par les oceans. Si les progres dans ce domaine sont bien reels pour certains stocks de grande importance commerciale, la situation est dierente pour les stocks dits a donnees limitees. Souvent historiquement moins exploites, ces stocks ne benecient pas des m^emes ressources, tant economiques qu'humaines, pour realiser une evaluation de stock permettant par la suite la mise en place de mesures de gestion. Ce travail s'appuie sur deux cas d'etude, le lieu jaune (Pollachius pollachius) et la seiche (Sepia officinalis), an d'explorer des methodologies d'evaluation de stocks adaptees aux situations de donnees limitees. Apres une premiere partie introductive reprenant le contexte de l'evaluation des stocks et presentant les deux cas d'etude, une revue des methodes d'evaluation de stocks a donnees limitees est proposee. Une troisieme partie compare les resultats d'un modele de biomasse a deux stades et d'un modele multi-annuel de depletion generalise appliques au stock de seiche de Manche. Une version amelioree du modele de biomasse a deux stades code en Bayesien est egalement presentee. Le travail se poursuit avec l'application d'un modele d'analyse integree Stock Synthesis au stock de lieu jaune de mer Celtique. Les resultats sont compares aux resultats de modeles plus simples necessitant moins de donnees. Les resultats du modele Stock Synthesis s'averent sensibles aux hypotheses sur la valeur de mortalite naturelle, dont le calcul depend des parametres de croissance du stock. La cinquieme partie  presente l'acquisition et le traitement de nouvelles donnees qui pourront permettre une meilleure estimation de l'etat du stock de lieu jaune. Un modele hierarchique Bayesien est construit, permettant un transfert d'information entre trois stocks et la mise a jour des parametres biologiques du lieu jaune. Le dernier chapitre conclut ce travail en reprenant les principaux resultats obtenus et en elargissant la discussion sur des perspectives de recherche.

The assessment and the management of sh stocks aim at achieving a sustainable exploitation of the resources provided by the oceans. While progress have been made in this eld for some stocks of great commercial importance, the situation is di erent for the so-called "data limited" stocks. Often historically less exploited, these stocks do not  benefit from the same economical resources nor workforce to conduct the stock assessments required to set management measures. This work is based on two case studies, pollack (Pollachius pollachius) and cuttlefish (Sepia officinalis). The aim is to investigate the stock
assessment methods adapted to data-limited situations. A first introductive part presents the background of fish stock assessment as well as the two case studies. This first chapter is followed by a review of data-limited stock assessment methods. The third part compares the results of a two-stage biomass model with the results of a multi-annual generalized depletion model applied to the English Channel stock of cuttlefish. An improved version of the Bayesian two-stage biomass model is also presented. In the fourth part, a Stock Synthesis model based on integrated analysis methods is applied to the stock of pollack in the Celtic Seas Ecoregion. The results are compared to the results of simpler models which require less data. The Stock Synthesis model results are sensitive to the assumptions on the natural mortality value, which relies on the growth parameters of the stock. The fifth part presents the collection and analysis of new data which will allow a better estimate of pollack stock status. A Bayesian hierarchical model is constructed, allowing information transfer between three stocks and the update of pollack biological parameters. The last chapter concludes this work by summarizing the main results. The discussion is extended to the research perspectives.