La production d'huître creuse, Crassostea gigas, est la principale production française de coquillages et la plus importante source de revenu du département de la Charente Maritime. Le naissain est principalement obtenu par captage naturel mais l'utilisation de naissain d'écloserie est en progression depuis quelques années. De forts taux de mortalité estivale, pouvant atteindre 60 à 100% sont rapportées actuellement dans les écloseries-nurseries, sur les larves et le naissain d'huître creuse, Crassostrea gigas. Dans le milieu naturel, la mortalité apparaît aussi sur le naissain de captage naturel. Cette mortalité est difficile à évaluer car les informations à ce sujet sont souvent contradictoires. En ce qui concerne le naissain de captage naturel, la mortalité est de surcroit difficile à apprécier car leur qualité est très variable selon les années, en fonction des conditions climatiques. Ce type de mortalité a été observée dès 1991 dans les écloseries nurseries peut-être en raison de l'intensification de ces élevages qui fait apparaître les problèmes de manière plus évidente. L'huître plate, Ostrea edulis est, elle aussi, touchée par ce phénomène. Des études ont été menées pour rechercher la cause de la mortalité estivale. Un agent pathogène de type herpès a été mis en évidence par observation en microscopie électronique à transmission (Nicolas et al.,1992) en relation avec de la mortalité larvaire. Des mortalités associées à la détection d'un virus de type herpès ont également été rapportées sur naissain d'huître plate (Comps et Cochennec, 1992) et d'huître creuse (Renault et al., 1994). La pathogénicité de ce virus de type herpès a été prouvée pour les stades larvaires (Le Deuff et al., 1994) mais la reproduction expérimentale de la maladie sur le naissain, touché lui aussi par ces mortalités, fait encore l'objet d'étude. La corrélation entre les très fortes mortalités subies en 1995 par l'écloserie-nurserie Grainocean (ne de Ré) sur du naissain et la présence du virus n'apparaissait pas de manière évidente. Au début de l'année 1996, l'entreprise Grainocean et le laboratoire GAP (lFREMER de Ronce les Bains) ont convenu d'un programme de recherche en bactériologie sur des échantillons de l'écloserie-nurserie. La découverte de l'agent virale n'excluant pas la possibilité de l'intervention d'un agent pathogène bactérien, nous avons entrepris d'étudier la flore bactérienne en relation avec des épisodes de mortalité. En parallèle, un contrôle en PCR a été réalisé pour rechercher le virus de type herpès sur les lots utilisés dans cette étude. Aucun prélèvement provenant du milieu naturel n'a été traité au cours de cette étude car les anomalies et la mortalité sont détectées plus tardivement qu'en écloserie-nurserie et les échantillons foumis ne permettent pas une analyse bactériologique du fait de leur état de dégradation. Nous avons donc effectué la recherche en bactériologie uniquement sur les prélèvements de l'écloserie-nurserie Grainocean sur un  cheptel observé quotidiennement et avec un suivi des mortalités plus adapté à cette étude. L'étude que nous allons vous présenter doit être concidérée comme une première approche pour laquelle nous avons choisi d'étudier les souches du genre Vibrio, réputés pour leur pathogénicité en milieu marin.