L’étude de zone des lotissements conchylicoles de la lagune de Thau (34.39) a été menée, à la demande du Comité Régional de la Conchyliculture en Méditerranée et du préfet de l’Hérault, pour étudier la possibilité de sectoriser la zone de production en sous-zones, au regard du risque microbiologiques (REMI). Une étude de dossier a été réalisée afin de recenser les principales sources de contamination. Celles-ci sont essentiellement d’origine anthropique et impactent différemment les secteurs envisagés. Des prélèvements de coquillages du groupe 3 ont été réalisés de mai 2017 à mai 2018 avec une fréquence bimensuelle. Au regard des critères du règlement (CE) n° 854/2004, les résultats des analyses microbiologiques (indicateur Escherichia coli) ont permis d’estimer la qualité microbiologique à B pour la zone de production 34.39 et à B pour les trois zones considérées séparément. Les points proposés pour le suivi ultérieur des zones sont les points les plus sensibles aux contaminations. Ils sont au nombre de trois dans la zone de Bouzigues, deux dans la zone de Mèze, trois dans la zone de Marseillan. En complément de cette nouvelle stratégie d’échantillonnage, trois scénarios de découpage en sous-zones ont été analysés. Une analyse de la variabilité spatio-temporelle des blooms de phytoplanctons toxiques a également été réalisée à la demande du Préfet de l’Hérault. A l’issue de cette analyse, des propositions en lien avec l’évaluation du risque lié aux phycotoxines sont présentées.