RikiGEN-2 est un projet de R&D d'une durée de 4 ans (2016-2019), qui fait suite au projet RikiGEN (Valorisation génétique des huîtres perlières de l'archipel des Gambier) financé par le Ministère des Outres-mers (appel à projet MOM sur la période 2013 à 2015). L'écloserie de production associée à la sélection génétique appliquée à l'huître perlière P. margaritifera constitue une voie privilégiée pour améliorer la qualité de production. Grâce au partenariat avec un industriel écloseur, la SCA Regahiga, des animaux issus des premiers cycles de sélection sur la couleur et la croissance vont pouvoir être étudiés à l'échelle de la production aussi bien en tant qu'huîtres donneuses que receveuses. La comparaison des performances en production des huîtres perlières issues d’écloserie, en comparaison aux témoins sauvages (issus de collectage naturel), permettra : 1) d'estimer le progrès génétique réalisé, dans le cadre d'un dispositif multi-sites et pluriannuels, et 2) d’évaluer le niveau de variabilité génétique au sein des descendants produits en écloserie. Par ailleurs, les outils de biologie moléculaire développés tant pour le greffon (croissance coquillière) que pour la poche perlière (croissance perlière), permettront la recherche de signatures moléculaires spécifique d'une mutation de coloration de chair (et de perle) et des performances de croissance. Ces travaux nous permettront de répondre aux questions majeures suivantes : 1) quelle est la stratégie de sélection génétique la plus adaptée à P. margaritifera ?, 2) quels sont les gains génétiques possibles sur la croissance ?, 3) les familles d’écloserie sont-elles génétiquement moins variables que celles issues du collectage naturel ?, et 4) quels sont les biomarqueurs à l'origine de la variation de la qualité des perles de culture ?