Les diagnostics des peuplements de poisson d’intérêt halieutique et des principaux stocks mettent en évidence des états contrastés à Mayotte en 2017. A l’échelle des peuplements, toutes espèces confondues, aucun signe patent d’un état non satisfaisant lié à la pression de pêche exercée n’a été observé. Cette situation s’explique en grande partie par les familles les plus diversifiées et les plus abondantes, souvent herbivores, tels que les poissons chirurgiens et les perroquets, dont l’état est jugé satisfaisant. En revanche, l’état des quatre principales familles de grands carnivores (les mérous, les vivaneaux, les capitaines et les carangues) est qualifié de non satisfaisant. La raréfaction des grandes espèces, voire la perte de diversité dans les structures d’habitat, les faibles abondances relevées, et bien souvent des structures de taille déséquilibrées par l’absence des petits poissons et/ou de grands poissons, accentuent la sensibilité à la pêche de ces familles et des espèces qui les composent, ce qui questionne sur la durabilité de leur exploitation. Ainsi, seules cinq espèces parmi les treize évaluées ont été classées dans un état satisfaisant. Il s’agit généralement d’espèces dont les tailles maximales ou communes ne dépassent pas 60 cm. Les plus grandes espèces ciblées historiquement (taille maximale supérieure à 1 mètre) sont rarement, voire non observées dans les comptages sur les habitats du lagon et des pentes externes et de l’Iris et ce jusqu’à 60 mètres de profondeur. Cette situation est caractéristique d’une pression de pêche excessive sur des espèces généralement qualifiées de vulnérables. L’état des peuplements et des stocks est également dépendant de l’état de santé des habitats coralliens et de leur diversité, essentiels au développement des espèces.