Pour mettre en évidence les caractères d’adaptation des plantes, nous avons observé le métabolome de feuilles du genre Erythrophleum tropical de type sauvage comprenant l’ensemble des métabolites particuliers présents dans un organe à un moment donné. Pour répondre à ces questions écologiques, des approches génétiques en tant que marqueurs génétiques neutres (tels que les microsatellites) sont généralement utilisées pour évaluer la manière dont les forces évolutives interagissent pour façonner les variations phénotypiques observées au sein de populations naturelles. Les métabolites étant le résultat d’un réseau complexe d’expression génique, d’expression de protéines, d’interactions et de processus de régulation, ils sont donc plus proches du phénotype que le transcriptome ou le protéome. Les métabolites secondaires résultant de voies de biosynthèse spécifiques possèdent des caractéristiques structurelles caractéristiques en fonction des formes alléliques spécifiques des enzymes impliquées dans leur biosynthèse. Un exemple de cette signature phylogénétique se trouve dans l'Erythrophleum (Fabaceae, Caesalpinioideae) qui contient des diterpènes de cassane originaux, limités à divers genres de Fabaceae. Nous avons étudié deux espèces aux origines géographiques variées: (i) E. Ivorense qui pousse dans les forêts tropicales humides de Guinée, du Gabon et du Congo, formant de larges peuplements; et (ii) E. Suaveolens qui pousse dans les zones montagneuses semi-humides et se trouve dans la savane guinéenne, sur la bande de terre allant de la Gambie au nord-ouest au Kenya à l'est et du Mozambique au sud-est au peuple. République du Congo au sud-ouest. Pour cette étude, tous les individus ont été cultivés et rassemblés dans un jardin commun au Cameroun.
Après une exploration métabolomique par LC-HRMS et une corrélation multi-blocs du génotype avec le métabolome et pour l'exploration du phénotype basé sur le métabolome, nous avons développé un pipeline de déréplication en réseaux moléculaires basé sur MS / MS et centré sur la famille des diterpènes de cassane. Le logiciel convivial Metgem a été utilisé pour la construction de réseaux moléculaires. Les principaux résultats de la déréplication seront présentés.

To highlight plant adaptive traits, we have observed the metabolome from leaves of wild type tropical Erythrophleum genus that includes the set of particular metabolites present in an organ at a certain time. To answer those ecological questions, genetic approaches as neutral genetic markers (like microsatellites) are usually used to evaluate how evolutionary forces interact to shape phenotypic variations observed among natural populations. As metabolites are the result of a complex network of gene expression, protein expression and interactions and other regulatory processes, they are therefore closer to the phenotype than transcriptome or proteome. Secondary metabolites resulting from specific biosynthetic pathways possess characteristic structural features depending on the specific allelic forms of enzymes involved in their biosynthesis. One example of such phylogenetic signature is found in the Erythrophleum (Fabaceae, Caesalpinioideae) which contains original cassane diterpenes, restricted to various Fabaceae genera. We have studied two species with various geographical origins: (i) E. Ivorense that grows in the rainforests of Guinea, Gabon and Congo, forming wide stands; and (ii) E. Suaveolens that grows in mountainous semi-humid areas and is found in the Guinean savannah, on the strip of land that runs from Gambia in the northwest to Kenya in the east, and from Mozambique in the southeast to the People’s Republic of the Congo in the southwest. For this study, all individuals were cultivated and collected in a common garden in Cameroun. After a metabolomic exploration by LC-HRMS and multi-block correlation of genotype with metabolome &[DT1]  for the exploration of the phenotype based on the metabolome, we have developed a molecular networking dereplication pipeline based on MS/MS focusing on cassane diterpenes family. For molecular network construction the user-friendly Metgem software has been used. Principal results of dereplication will be presented.

 [DT1]???