Les écosystèmes benthiques des eaux profondes de la zone économique exclusive française de Kerguelen demeurent mal connus. Pour la prise en compte des enjeux de conservation associés, la récente extension de la Réserve naturelle nationale des Terres australes françaises a majoritairement reposé sur une étude à dire d’expert à laquelle ont contribué les auteurs de cet article. Dans cette nouvelle étude, nous proposons une écorégionalisation benthique fondée sur une méthodologie rigoureuse et reproductible, utilisant une technique de modélisation (generalised dissimilarity modelling) appliquée aux données de macro-épibenthos issues de la campagne halieutique POKER 2 (2010). Nos résultats permettent notamment i) de caractériser des unités écopaysagères benthiques fondées sur des assemblages d’invertébrés marins rassemblés par taxons et par regroupements fonctionnels, ii) de mettre en évidence les facteurs environnementaux de la structuration spatiale de ces assemblages benthiques, iii) de confirmer la pertinence du choix des taxons retenus par la CCAMLR comme bio-indicateurs des écosystèmes marins vulnérables, iv) de fournir une évaluation de la pertinence des « Zones de Protection Renforcée » de la nouvelle réserve marine au regard de la conservation des écosystèmes benthiques profonds.

The deep-sea benthic ecosystems of the French Kerguelen exclusive economic zone remain poorly understood. To address benthic conservation issues, the authors recently contributed expert knowledge to guide the recent extension of the Marine Reserve of the ‘Terres australes françaises’. In this new study, we propose a benthic ecoregionalisation of the northern Kerguelen Plateau based on a measurable and repeatable methodology that relies on the generalised dissimilarity modelling technique. Data of macro-epibenthic invertebrate species from the POKER 2 (2010) fish stock assessment survey have been used to compute the models. Our results allow us (i) to characterise and map benthic landscape units based on assemblages of marine invertebrates pooled by taxa and life-history traits, (ii) to highlight the environmental drivers of the spatial distribution of benthic assemblages, (iii) to assess the relevance of the CCAMLR’s vulnerable marine ecosystems bioindicator taxa, and (iv) to assess the effectiveness of ‘strictly protected areas’ of the new Marine Reserve for the conservation of deep-sea benthic ecosystems.