Les huîtres sont des invertébrés marins essentiels dans nos écosystèmes côtiers. Ces architectes de l'environnement rendent de nombreux services écosystémiques tout en soutenant une activité économique séculaire, florissante, patrimoniale et structurante des paysages littoraux. Mais, avant toute chose, ces organismes suspensivores, capables de constructions récifales, jouent un rôle clé dans le fonctionnement de nombreux écosystèmes côtiers en créant des habitats biogéniques marins remarquables sur l'estran et dans le domaine infralittoral.

Il existe en France deux espèces d'huîtres : l'huître plate, Ostrea edulis, native d'Europe et l'huître creuse, Crassostrea gigas, introduite il y a 50 ans pour sauver l'ostréiculture française et désormais installée naturellement sur de nombreuses côtes européennes. Même si leur origine, leur histoire et leur écologie sont différentes, ces deux espèces partagent un destin commun : leur rôle essentiel dans l'équilibre des écosystèmes et la même fragilité face aux pressions anthropiques croissantes. Ces espèces sont en effet totalement dépendantes des conditions environnementales locales (température, abondance et de la qualité du phytoplancton, salinité, débit des rivières, circulation hydrodynamique côtière...) et plus généralement des variations globales du climat. Le changement climatique en cours, associé à la dégradation de leurs habitats, a des répercussions plus ou moins directes sur leur cycle de vie, mais avec des différences majeures selon l'espèce.

En travaillant sur ces deux modèles biologiques complémentaires, au cours des 20 dernières années, mon objectif scientifique a donc consisté à mieux comprendre les processus clés régissant ce cycle de vie en milieu naturel. Je me suis intéressé notamment à leur écologie, leur cycle de reproduction, le déterminisme de leur recrutement, la dynamique et le maintien des populations sauvages, leur conservation puis leur restauration écologique, le tout dans un milieu côtier soumis à multiples pressions anthropiques. Outre son intérêt premier pour des problématiques en aquaculture, mais également en halieutique, mon travail de recherche s'est également orienté vers des questions liées aux effets du changement climatique et à l'érosion de la biodiversité.

Dans ce contexte, cette Habilitation à Diriger des Recherches vous propose une synthèse de 20 années de recherche en écologie et écophysiologie des mollusques. Elle se base sur des actions de recherche combinant des études en laboratoire (in vitro), en milieu naturel (in situ) et en modélisation (in silico) menées sur différents sites ateliers depuis le bassin d'Arcachon jusqu'à la Rade de Brest en passant par la lagune de Thau. Ce travail de synthèse, associant contexte scientifique et publications personnelles, est organisé en trois grandes parties construites en suivant le cycle de vie bentho-pélagique de ces espèces, depuis l'écologie de la larve pélagique à la formation des récifs biogéniques en passant par l'écophysiologie de l'adulte dans sa phase benthique.

D’une façon plus générale, l'enseignement apporté par cette HDR vise à montrer, au travers de ces deux organismes sentinelles pris comme modèles, les profonds effets du changement en cours de notre biosphère. Mieux comprendre ce changement, c’est aussi mieux s’y adapter en cherchant localement des voies de remédiation. En milieu côtier, ces espèces sont en effet pourvoyeuses de Solutions fondées sur la Nature en parallèle de leur importance économique pour la conchyliculture ou la pêche. Face aux différentes crises environnementales qui nous touchent, le temps est vraiment venu de repenser notre relation à la Nature. Modestement, cette HDR ouvre à son niveau une voie de transition écologique et propose une vision alternative empreinte de résilience et d'adaptation.

La vidéo de la soutenance est disponible à l'adresse https://doi.org/10.24351/93937.

Oysters are essential marine invertebrates in our coastal ecosystems. These architects of the environment provide numerous ecosystem services while supporting a centuries-old economic activity that is flourishing, heritage and structuring in the coastal landscape. Above all, these suspension feeders, capable of reef construction, play a key role in the functioning of many coastal ecosystems by creating remarkable marine biogenic habitats on the foreshore and in the infralittoral domain.

There are two species of oysters in France: the flat oyster, Ostrea edulis, native to Europe, and the Pacific oyster, Crassostrea gigas, introduced 50 years ago to save French oyster farming and now naturally established on many European coasts. Even if their origin, history and ecology are different, these two species share a common fate: their essential role in the functioning of ecosystems and the same fragility in front of increasing anthropic pressures. These species are totally dependent on local environmental conditions (temperature, abundance and quality of phytoplankton, salinity, river flow, coastal hydrodynamic circulation, etc.) and more generally on global climate variations. The current climate change, associated with the degradation of their habitats, has direct repercussions on their life cycle, but with major differences depending on the species.

By working on these two complementary biological models over the last 20 years, my scientific objective has therefore been to better understand the key processes governing their life cycles in the natural environment. In particular, I have been interested in their ecology, their reproductive cycle, the determinism of their recruitment, the dynamics and maintenance of wild populations, their conservation and then their ecological restoration, all in a coastal environment subject to multiple anthropic pressures. In addition to its primary interest in aquaculture and fisheries issues, my research work has also focused on questions related to the effects of climate change and the erosion of biodiversity.

In this context, this "Accreditation to supervise research" (in french "Habilitation à Diriger des Recherches", HDR) offers a synthesis of 20 years of research in ecology and ecophysiology of molluscs. It is based on research activities combining laboratory studies (in vitro), studies in the natural environment (in situ) and modelling (in silico) carried out at various coastal sites from the Arcachon Bay to the Rade de Brest and the Thau Lagoon. This synthesis, combining scientific context and personal publications, is organised in three main parts, following the bentho-pelagic life cycle of these species, from the ecology of the pelagic larva to the formation of biogenic reefs, via the ecophysiology of the adult in its benthic phase.

More generally, the messages provided by this HDR aim to show, through these two sentinel organisms taken as models, the profound effects of the ongoing change in our biosphere. A better understanding of this change also means better adaptation by seeking local remediation measures. In coastal areas, these species provide Nature-based Solutions in addition to their economic importance for shellfish farming and fishing. Faced with the various environmental crises that affect us, the time has truly come to rethink our relationship with Nature. Modestly, this HDR opens at its level a way of ecological transition and proposes an alternative vision marked by resilience and adaptation.

The video of the defense is available at https://doi.org/10.24351/93937.