Les norovirus et sapovirus sont des virus appartenant à la famille des Caliciviridae qui causent respectivement 18% et 3,4% de l’ensemble des cas de gastro-entérites à travers le monde. Les personnes infectées excrètent ces virus qui sont présents en grandes quantités dans les eaux usées. Un assainissement défectueux peut alors conduire à la présence de ces virus dans l’environnement, dont les zones littorales où sont produites les huîtres. Ces mollusques bivalves filtreurs se nourrissent en filtrant l’eau de mer, et peuvent accumuler ces pathogènes dans leurs tissus. Le norovirus est connu pour son association particulière avec les huîtres, notamment Crassostrea gigas. En effet, elles expriment des glycanes de type antigène tissulaire de groupe sanguin dans leurs tissus, analogues au récepteur d’attachement des norovirus chez l’Homme. Pour les sapovirus, ces récepteurs ne sont pas connus en l’absence de modèle de réplication in vitro. Durant cette thèse, un protocole a été mis au point pour étudier l’expression de ces glycanes par les cellules d’huître et les interactions entre les norovirus et ces cellules. Il a permis de montrer que ces interactions sont possibles, mais que dans les huîtres, les norovirus seraient majoritairement en interaction stable avec des molécules extracellulaires. Dans un autre axe de cette thèse, nous avons identifié des souches de sapovirus humain capables de répliquer sur des entéroïdes intestinaux humains, qui ont permis d’approfondir les connaissances sur ce virus peu étudié. Son tropisme mais également ses interactions avec les antigènes tissulaires de groupe sanguin des cellules intestinales humaines ont été investigués. Cette thèse a donc développé des outils méthodologiques permettant l’étude des cellules d’huîtres et leurs interactions avec les norovirus, mais également de répliquer les sapovirus sur un modèle cellulaire innovant

Norovirus and sapovirus are both members of the Caliciviridae viral family. They are respectively the cause of 18% and 3.4% of all cases of gastroenteritis worldwide. Infected people shed high amounts of viruses that are carried into wastewaters. Sewage treatment failure can then lead to the fecal contamination of the environment, including coastal areas where oysters are produced. These filter-feeding bivalve molluscs can accumulate these pathogens in their tissues. Norovirus is known for its specific association with the Crassostrea gigas species, known to express in its tissues some glycans similar to the human blood-group antigens that are an attachment factor of norovirus in the human gut. Such attachment factors are not known for sapoviruses, in the absence of an in vitro replication model. During this thesis, a protocol was developed to to study the expression of glycans by oyster cells and their interactions with norovirus. It allowed us to show that these interactions are possible, but that the main ligand of norovirus in oysters is extracellular. In a second axis of this thesis, we were able to identify two strains of human sapovirus replicating in vitro in human intestinal enteroids, which allowed us to deepen our knowledge of this virus. Its tropism but also its interactions with human blood-group antigens on human intestinal cells were investigated. This thesis has therefore developed methodological tools allowing the study of oyster cells and their interactions with noroviruses, but also to replicate sapoviruses on an innovative cell model