An evaluation of bias and prediction skill for the East Atlantic bluefin stock assessment

Type Article
Date 2018
Language English
Other localization https://www.iccat.int/Documents/CVSP/CV074_2017/n_6/CV074063052.pdf
Author(s) Kell L.T.1, Ben Mhamed A.2, Rouyer Tristan3, Kimoto A.4
Affiliation(s) 1 : ICCAT Secretariat, C/Corazón de María, 8. 28002 Madrid, Spain
2 : INRH, Boulevard Sidi Abderrahman Ain Diab , maroc
3 : Ifremer Sète, UMR MARBEC, Avenue Jean Monnet 34200 Sète , france
4 : NRIFSF;5-7-1 Orido Shimizu Shizuoka, Japan
Source ICCAT Recueil de Documents Scientifiques / Collective Volume of Scientific Paper (1021-5212) (ICCAT), 2018 , Vol. 74 , N. 6 , P. 3052-3081
Note SCRS/2017/124
French abstract

Les modèles d'évaluation des stocks sont vulnérables aux observations anormales (valeurs atypiques), ce qui peut entraîner des estimations biaisées des paramètres, une sous-estimation de l'incertitude et une mauvaise capacité de prédiction. Ceci est particulièrement vrai lorsque le nombre d’observations est relativement faible, puisqu’il y a moins de cas pour prévenir les anomalies. Il est donc conseillé d’identifier les points influents, d’analyser leur impact et d’essayer de trouver les raisons de leur présence, en se demandant par exemple s’ils sont dus à des erreurs de codage, à l’exclusion d’importantes variables explicatives, à la structure incorrecte du modèle, au comportement du pêcheur, à la gestion ou à la non stationnarité dans les processus biologiques ? Dans cet article, nous utilisons des diagnostics de régression, la procédure par eustachage et la validation par recoupement pour évaluer l’influence des observations individuelles de la série de capture par unité d’effort utilisée pour calibrer l’évaluation de l’analyse de population virtuelle du thon rouge de l’Atlantique Est et de la Méditerranée.

Keyword(s) Bias, Cross Validation, Diagnostics, Jackknife, Prediction Skill, Stock Assessment, Residuals
Abstract

Stock assessment models are vulnerable to abnormal observations, which may result in biased estimates of parameters, underestimation of uncertainty, and poor prediction skill. This is especially true when the number of observations are relatively small since there are fewer cases to counter abnormalities. It is therefore advisable to identify influential points, explore their impact, and to try and find reasons for their occurrence, e.g. are they due to miscodes, exclusion of important explanatory variables, incorrect model structure, fisher behaviour, management or non-stationarity in biological processes? In this paper we use regression diagnostics, the jackknife and crossvalidation to evaluate the influence of individual observations from the catch per unit effort series used to calibrate the East Atlantic and Mediterranean bluefin Virtual Population Analysis assessment.

Abstract <p>Los modelos de evaluaci&oacute;n de stock son vulnerables a observaciones anormales, que podr&iacute;an dar lugar a estimaciones sesgadas de los par&aacute;metros, a una subestimaci&oacute;n de la incertidumbre y a una capacidad pobre de predicci&oacute;n. Esto es especialmente cierto cuando el n&uacute;mero de observaciones es relativamente peque&ntilde;o dado que existen menos casos para contar las anormalidades. Por tanto, es aconsejable identificar puntos influyentes, explorar su impacto e intentar hallar razones para que se produzcan, por ejemplo, &iquest;se deben a c&oacute;digos err&oacute;neos, a la exclusi&oacute;n de importantes variables explicativas, a una estructura incorrecta del modelo, al comportamiento de los pescadores, a la ordenaci&oacute;n o a la no estacionalidad en los procesos biol&oacute;gicos? En este documento se utilizan diagn&oacute;sticos de regresi&oacute;n, el jacknife y la verificaci&oacute;n cruzada para evaluar la influencia de las observaciones individuales a partir de las series de capturas por unidad de esfuerzo utilizadas para calibrar la evaluaci&oacute;n del an&aacute;lisis de poblaci&oacute;n virtual del at&uacute;n rojo del Atl&aacute;ntico este y el Mediterr&aacute;neo.</p>
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Publisher's official version 30 2 MB Open access
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How to cite 

Kell L.T., Ben Mhamed A., Rouyer Tristan, Kimoto A. (2018). An evaluation of bias and prediction skill for the East Atlantic bluefin stock assessment. ICCAT Recueil de Documents Scientifiques / Collective Volume of Scientific Paper, 74(6), 3052-3081. Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00857/96924/