Les canyons sous-marins sont des zones océaniques clés incisant le plateau continental et induisant des processus complexes dont les impacts ne sont pas encore totalement compris du fait des échelles impliquées. Cette thèse participe à la compréhension du rôle des canyons dans les échanges verticaux aux échelles événementielles ou résiduelles à l’aide d’observations et du modèle numérique CROCO. Le travail explore deux régions contrastées : le canyon de Cassidaigne, à l’est du golfe du Lion, et le canyon de Capbreton au sud du golfe de Gascogne. Dans le canyon de Cassidaigne, des écoulements verticaux transitoires ou stationnaires ont été observés pour la première fois en profondeur sous l’influence des dynamiques de surface. Un modèle numérique suggère un rôle significatif des canyons méditerranéens dans les échanges verticaux entre la plaine abyssale et le plateau du fait de la faible stratification profonde. Le canyon de Capbreton est d’avantage soumis à des mouvements transitoires (marées, tempêtes). La stratification profonde y favorise les marées internes et leur rôle dans les processus sédimentaires. Dans les deux cas, des écoulements turbiditiques sont reliés à des processus de relaxation hydrodynamique.

Submarine canyons are key morphological features incising the continental slope and inducing complex processes whose impacts are not yet fully understood due to the small scales involved. This thesis contributes to the understanding of the role of canyons in vertical exchanges at short or residual timescales, with the analysis of observations and CROCO numerical modeling. The work focuses on two contrasted regions: the Cassidaigne canyon, to the east of the Gulf of lion, and the Capbreton canyon, southern Bay of Biscay. In the Cassidaigne canyon, deep transient and stationary vertical flows were observed for the first time under the influence of surface dynamics. A numerical model suggests a significant role of Mediterranean canyons in vertical exchanges between the abyssal plain and the shelf due to the weak deep stratification. The Capbreton canyon is more subject to transient movements (tides, storms). Deep stratification favors the existence of internal waves, interacting with sedimentary processes. In both cases, turbidity flows have been linked to hydrodynamic relaxation processes.