La pratique de l’expertise est inhérente au travail des scientifiques, dans l’objectif d’éclairer la société et les gestionnaires sur l’état des connaissances et sur les enjeux associés à l’exploitation des milieux marins. Pêche, énergies marines renouvelables, extractions de granulats marins, aménagements portuaires, conchyliculture sont quelques-unes des activités pouvant appeler à cet exercice d’application des connaissances scientifiques dans un cadre administratif. Pour le scientifique lui-même, l’expertise amène à réinterpréter des concepts écologiques dans un contexte donné et contraignant. Ce passage du cadre écologique au cadre administratif, tel que l’évaluation de l’impact potentiel des parcs éoliens sur les populations de poissons, ne permet pas systématiquement d’intégrer la réalité écologique des objets discutés. La distorsion entre la connaissance scientifique et sa prise en compte dans la gestion des écosystèmes marins peut alors générer une perte de sens du travail à accomplir pour l’expert. L’étude du jeu d’acteurs et des attentes de l’ensemble des parties en présence peut permettre d’identifier les points de conflit ou d’incompréhension qui limitent l’efficacité des démarches de concertation mises en œuvre. Dans un contexte de crise écologique, cette analyse pourrait mettre en lumière les limites de l’exercice de la communication scientifique telle qu’elle se pratique aujourd’hui et appeler à de nouvelles initiatives. Pour illustrer ce propos, nous présenterons le cas du protocole de référence halieutique pour le suivi des sites d’extraction de granulats marins. Issu d’une consultation entre l’État, les scientifiques et les industriels, ce protocole a longtemps été contesté en raison du caractère mobile des populations de poissons et d’attentes jugées incompatibles avec le cadre administratif dans lequel il vient s’inscrire. Pour répondre à ces critiques, c’est une démarche avant tout pédagogique qu’il a fallu déployer, aboutissant à la création d’une interface graphique de traitement des données, destinée à aider les industriels et les bureaux d’étude à s’approprier les concepts scientifiques sous-tendant le protocole de référence halieutique.