En écloseries expérimentales et commerciales d’huîtres creuses Magallana gigas, des mortalités récurrentes sont observées, pouvant être le fruit d’une multitude de facteurs. De ce fait, l’Ifremer a monté le projet « Amélioration des performances en élevages larvaires d’invertébrés marins » (ALADIN) dans lequel s’intègre la présente publication. Ce mémoire, mené à la Plateforme Mollusques Marins de La Tremblade, a pour objectif de limiter les communautés bactériennes pathogènes en optimisant la zootechnie plutôt que d’avoir recours systématiquement à des antibiotiques. Un élevage larvaire statique d'huîtres creuses a été mené, de la reproduction jusqu'à la fixation, afin d'évaluer l'impact des pratiques d'élevage telles que le changement d'eau des bacs, la densité larvaire et le traitement antibiotique sur les performances larvaires. Les communautés bactériennes présentes dans les compartiments eau de mer, larves et phytoplancton ont également été identifiées par metabarcoding 16S. Cette étude a montré que l’utilisation d’antibiotiques n’a aucun effet sur les performances larvaires tandis que le changement d’eau quotidien favorise la croissance et la fixation des larves et que la densité d’élevage favorise la survie, la croissance et la fixation. De plus, des bactéries pathogènes du genre Vibrio ont été identifiées, et ce malgré l’utilisation d’antibiotiques. Ainsi, en optimisant les paramètres zootechniques et utilisant un antibiotique seulement en curatif, les performances peuvent être améliorées.

In commercial and experimental Pacific oysters, Magallana gigas, hatcheries, recurring mortalities have been observed, which can be caused by various factors. Therefore, Ifremer has created the project ALADIN, “Amélioration des performances en élevages larvaires d’invertébrés marins”, of which this publication is a part. The main goal of this study, which took place at the PMMLT, “Plateforme Mollusques Marins de La Tremblade”, is to reduce pathogenic bacterial communities by optimizing zootechny rather than routinely using antibiotics. To assess the impact of rearing practices, such as water changes, larval densities and antibiotic use, on larval performances, a static larval rearing of M.gigas was conducted. Bacterial communities in seawater, larvae and phytoplankton compartments were identified with metabarcoding 16S. The results suggest that antibiotics don’t have any effect on larval performances, whereas daily water changes improve larval growth and fixation and reduced larval densities improve larval survival, growth and fixation. Furthermore, pathogenic bacteria from Vibrio genus were identified, despite the use of antibiotics. To conclude, optimizing zootechny and using antibiotics only as a curative measure, could improve larval performances

Mots-clés : bactéries, Magallana gigas, zootechnie, écloserie, metarcoding 16S, optimisation.